Marr tornó a la música en 1989 con Bernard Sumner (de New Order ) y

Marr tornó a la música en 1989 con Bernard Sumner (de New Order ) y Neil Tennant (de los Pet Shop Boys ) nel supergrupu Electronic . Electronic editó tres álbumes a lo llargo de la década siguiente. Marr tamién foi miembru de The The , grabando dos álbumes cola banda ente 1989 y 1993. Trabayó amás como sesionista y collaborador con artistes como The Pretenders , Pet Shop Boys, Billy Bragg y Black Grape . Nel 2000 fundó otra banda, Johnny Marr And The Healers , que llogró moderáu ésitu, y más tarde trabayó como músicu nel álbum d’ Oasis Heathen Chemistry . Amás, trabayó como productor.