Yhtye jäi taas lyhyelle tauolle kunnes vuonna 1999 julkaistiin single

Yhtye jäi taas lyhyelle tauolle kunnes vuonna 1999 julkaistiin single ” Pumping on Your Stereo ”. Kappaleen promovideo julkaistiin yhteistyössä Jim Henson’s Creature Shopin kanssa ja siinä esiintyi muppet -hahmoja. Single sai hyvän vastaanoton samoin kuin heidän pienimuotoinen loppuunmyyty kiertueensa singlen julkaisun aikaan. Kiertueen viimeinen konsertti pidettiin Shepherds Bush Empiressa osana MTV:n Five Night Stand -festivaalia. Supergrassin kolmas pitkäsoitto Supergrass julkaistiin syyskuussa 1999 . Sitä kutsutaan myös Röntgenalbumiksi , sillä kansikuvissa on röntgenkuvia yhtyeen jäsenten päistä. Albumi julkaistiin seuraavana keväänä Yhdysvalloissa. Tämäkin albumi nauhoitettiin Sawmill Studiolla yhtyeen pitkäaikaisen yhteistyökumppanin John Cornfieldin kanssa Supergrass sai kriitikoilta hyvän vastaanoton ja sittemmin se on myynyt platinaa Britanniassa, mutta ei saanut samaa suosiota kuin edeltäneet albumit. Heidän seuraava singlensä, ” Mary ” nousi brittien top 40:een. Sen jälkeen yhtye piti pitkän tauon.