W 1986 roku wydany zostaje album The Deluge , Mark Shelton uznał ten

W 1986 roku wydany zostaje album The Deluge , Mark Shelton uznał ten album za swój najlepszy . Nagranie charakteryzuje się większą złożonością utworów oraz coraz większymi wpływami thrash metalu. W 1987 roku Manilla Road osiąga nowy poziom intensywności, spowodowane to było zdrową rywalizacją wewnątrz zespołu, Mark Shelton oraz Randy Foxe byli ciekawi, który z niech potrafi zagrać szybciej na swoim instrumencie. Wynikiem tego był album Mystification , który wykonany został w stylu thrash metalowym, wciąż jednak utrzymując specyficzny styl atmosfery Manilla Road . Tematyka tekstowa inspirowana była horrorem gotyckim, w tym między innymi twórczością Edgara Allan Poe . Pierwotnie w okresie swojej premiery album nie osiągnął dobrego wyniku sprzedażowego, jednak po latach został doceniony i uznany za jeden z najlepszych przez fanów. W okolicach premiery płyty Mystification, Black Dragon Records wpada w problemy finansowe, zostawiając zespół z kłopotami wizerunkowymi. Manilla Road przechodzi wówczas pod skrzydła Leviathan Records, założonego przez Davida T. Chastaina.