Nel 1987 venne pubblicato Mystification , un album registrato in soli

Nel 1987 venne pubblicato Mystification , un album registrato in soli 6 mesi partendo dalla pubblicazione di The Deluge , che confermò quanto detto per i precedenti tre album: esso è suonato nel classico stile dei Manilla Road e le sue liriche restano epiche (stavolta basate sulle opere di Edgar Allan Poe ). Le reazioni del pubblico e della stampa furono sempre positive, ma meno rispetto a quelle per gli ultimi tre album. La band intraprese un tour insieme ai Liege Lord che attraversò tutti gli Stati Uniti, e durante il quale venne registrato il primo album dal vivo ufficiale dei Manilla Road: Roadkill . Esso ricevette giudizi positivi, ed è tutt’oggi un ottimo esempio della potenza live della band. Nel 1988 i Manilla Road tornarono sul mercato con Out of the Abyss , album più influenzato dal thrash metal della band fino ad allora, e per questo apprezzato di meno dai fan più puristi. Anche le liriche dell’album riflettevano questo “incattivimento” del sound, arrivando a trattare argomenti più “oscuri” come le scritture di Howard Phillips Lovecraft e Clive Barker . L’ultimo album della band prima dello scioglimento fu The Courts of Chaos , pubblicato nel 1990 . La registrazione dell’album fu molto difficile per la band, dato che Park e Foxe avevano litigato pesantemente e si rifiutarono di restare insieme nello studio, e quando casualmente i due si incontravano nessuno dei due proferiva parola. La maggior parte del lavoro venne quindi svolta da Mark Shelton. Dopo la pubblicazione dell’album e qualche data live i problemi tra Park e Foxe non sembravano attenuarsi, così Shelton decise di sciogliere la band per cercare di far riappacificare i due. Ma ciò non avvenne mai, e The Courts of Chaos divenne l’ultimo album dei Manilla Road per molti anni a venire. Nel 1992 la Black Dragon Records pubblicò un nuovo album dei Manilla Road, The Circus Maximus , che era in realtà un album solista di Mark Shelton. La Black Dragon mise il nome della band sull’album senza permesso solamente per vendere più copie.