Met de nieuwe bezetting begon de band te experimenteren met beter

Met de nieuwe bezetting begon de band te experimenteren met beter gepolijste productie. Guided by Voices tekende bij het grotere label TVT . Het album Do the Collapse (1999) werd geproduceerd door Ric Ocasek ( The Cars , Nada Surf , Weezer ). Het album werd matig ontvangen. Fans misten de lo-fi-benadering waar de band bekend om stond. Wel kwam er meer airplay , vooral dankzij “Teenage FBI” en “Hold on Hope”, beide afkomstig van Do the Collapse . De bezetting van de band was ondertussen wederom veranderd; alleen Pollard en gitarist Doug Gillard (afkomstig van Cobra Verde) bleef aan. Oudgedienden Demos en Macpherson keerden terug. Vóór de opnames van Isolation Drills (2001) sloot ook Nate Farley ( The Amps , The Breeders ) zich bij de band aan. Het album werd geproduceerd door Rob Schnapf ( Beck , Heatmiser , Elliott Smith ).