1999 kam es zu einem Comeback, als die Ursprungsformation die Rechte

1999 kam es zu einem Comeback, als die Ursprungsformation die Rechte am Namen zurückgewann und TSOL die Warped Tour spielten. Todd Barnes war allerdings in diesem Jahr an einem Hirn- Aneurysma gestorben, ihn ersetzte Jay O’Brien. 2001 und 2003 erschienen neue Alben auf Nitro Records , außerdem wurde erstmals in Europa getourt, wobei neben Headlinerkonzerten auch Auftritte im Rahmen der Deconstruction-Tour stattfanden. 2006 entschloss sich die Band zu pausieren, da Rouche und Emory Kalifornien verlassen hatten. 2007 fanden jedoch bereits wieder Konzerte innerhalb der USA statt. Im Januar 2009 veröffentlichte die Band ein kostenlos im Internet herunterladbares Album, das von David Bianco produziert worden war. 2013 wurde das TSOL-Lied Abolish Government/Silent Majority für den Soundtrack des Computerspiels Grand Theft Auto V verwendet und ist im Spiel auf dem fiktiven Radiosender Channel-X zu hören.