2004年 “Live and By Surprise” を決行。3月4日 ミネソタ州 ミネアポリス より『Under My Skin』のプロモーションを兼ね21箇所のシティーモールツアーをアメリカとカナダで行った。パフォーマンスはアコースティックベースの短時間のライブで、上記アルバム中心に選曲が行われた。ライブは開始の48時間前まで誰にも知らされないシークレットライブの形態をとっていたが、同ツアーは非常にポピュラーな存在となりアルバムのプロモーションに一躍買うこととなった。2004年3月25日の インディアナポリス のセットでは「He Wasn’t」「My Happy Ending」「Don’t Tell Me」「Take Me Away」「Nobody’s Home」「Sk8er Boi」「Complicated」などが披露された。これらのライブパフォーマンスは『 Avril Lavigne Live Acoustic 』としてアメリカのディスカウントストア「 ターゲット 」で発売された。
しかし 2004年 、数千に及ぶ世界中のファンの4thアルバム発売嘆願署名を受け、ポール単独の編集作業により4thアルバムの音源や一部のBサイド曲、およびデモ曲や未発表音源を含む3枚組の コンピレーション・アルバム 『 クレプタメイニア 』を発売。
しかし、大ヒットを記録したことによるCDセールスへのプレッシャーと、自分たちのやりたいこととのギャップに悩むようになり、 2004年 2月6日 に解散を発表。
バンドは2004年に活動休止を宣言し、パルンボはラリー・ゴーマンを含む新しいバンド、 ヘッド・オートマティカ を結成し、ベックは服飾の仕事に携わることになった。2004年の終わりにはトッド・ウェインストック、デイヴ・アレン、ラリー・ゴーマンの全員がバンドから解雇され、｢バンド内で何らかの和解し難いトラブルが発生して｣解散したらしいという噂話が囁かれる中、グラスジョーとしての未来は暗礁に乗り上げた。冗談であると思われるが、実際バンドのウェブサイトには一時｢ RIP GlassJAw(グラスジョーよ安らかに眠れ)｣と表示されていたことがある。バンドは解散しているということを否定し、現在進行中のパルンボのクローン病が活動休止の理由の一つだと発表した。メンバー間でのコミュニケーションが断絶している中、少なくともトッドの与り知らぬところで予定されていたライヴ(結局はキャンセルされるが)は、それが彼への(そして他のメンバーに対しての)通知だとするのなら、バンドから排除されたことを意味していた。トッドはバンドのウェブサイトで以下の声明を発表した。｢みんなが俺に12月に予定されているグラスジョーのライヴについて訊いてきた。でも俺はそれについて何も知らないんだ。そこでパソコンで確認してみると、確かにライヴは予定されている。少し考えた後、これは単なるミスだと思ってベックに電話して確かめようとした。そこで俺はベックがグラスジョーについて俺とは全く違うビジョンを持っていると知ったんだ。俺の知る限り、ベックは自らギターを弾き、パルンボとドラムとベースの二人の雇われミュージシャンでライヴをするつもりだ。ベックのグラスジョーについてのビジョンを知った後、俺はもうそこにはいないんだと判った。(中略)それをどう受け止めればいいのかは分からないけれど、とにかく俺は動かなければならないみたいだ。｣そして彼は脱退するとメン・ウィメン・アンド・チルドレンを結成した。
2004年にザ・キラーズのフロントマンとしてデビュー。
2004年 のアルバム『リヴィング・シングス』には、 ヴァン・ダイク・パークス がゲスト参加。また、 ハンソン のアルバム『アンダーニース』のタイトル曲を、ハンソンのメンバー3人と共作。
2004年には欧州最大のフェス、 グラストンベリー・フェスティバル の大トリを ポール・マッカートニー や オアシス とともに務める。マシューが「これまでで最高の瞬間だった」と語るライブは成功に終わり、後に映像作品としてリリースされたが 、その陰では同日のライブを観に来たドミニクの父親が心臓発作で亡くなるという悲劇も起きていた 。同年には世界ツアーを展開し、夏にはクリスが手首を故障した際も急遽4人目のメンバーを入れて乗り切った 。ライブ・バンドとしての評価も高まり、2005年にはブリット・アワードとNMEアワードで「最優秀ライブ・バンド」に選ばれた。
その後しばらくバンドは ドラムマシン などを置いていたが、 2004年 末に アルゼンチン 出身のハヴィエを正式なドラマーとして迎え入れ、従来通りのスリーピース・バンドとして活動を再開する。
第三期the pillowsはオリジナル・アルバムの作成と並行して ベスト・アルバム や B-side集 をリリースし、2004年にはデビュー15周年を記念した セルフカバー アルバムと トリビュートアルバム を発表する など、多様な楽曲展開を行うようになった。2006年末にはレーベルをavex traxへと移し、2007年にはキングレコード在籍時にリリースされたシングルの収録曲を網羅した シングル・コレクション も発売されている 。またDVDなどの映像作品やバンドスコアなどの書籍の発売も積極的に行うようになった。
メリッサは、 スマッシング・パンプキンズ 解散後の 2004年 にソロ・アルバムを発表し、この作品には、元スマッシング・パンプキンズの ジェームス・イハ やエリックも参加している。なお、再結成したスマッシング・パンプキンズには、参加希望を表明していたが、今のところ加わっていない。