Im Januar 2006 betrat Underoath wieder das Studio um ihr fünftes

Im Januar 2006 betrat Underoath wieder das Studio um ihr fünftes Studioalbum Define the Great Line zu veröffentlichen. Produziert wurde es von Matt Goldman und Adam Dutkiewicz, Gitarrist von Killswitch Engage . Einige Monate vor dem Release erschien eine illegal veröffentlichte Version auf mehreren Internetseiten. Während der Studioarbeiten gründete der Schlagzeuger Aaron Gillespie sein Nebenprojekt The Almost . Zu seinem Entschluss äußerte er sich in einem Interview, dass er einfache Rockmusik machen wollte, was nicht zu Underoath passte. Underoath selbst bleibt aber sein Hauptprojekt. Define the Great Line wurde am 20. Juni 2006 veröffentlicht und erreichte im November 2006 Goldstatus. Gleiches gelang dem Album They’re Only Chasing Safety .